Музей Гибли посвящен крупнейшей анимационной студии, основанной Хаяо Миядзаки в 1985 году. Строительство самого музея было завершено только в 2001 году. Внешне и внутри здание музея стилизовано под мультипликацию: небольшой волшебный домик, расположенный в центральной части парка, позволяет посетителям очутиться в мире Гибли.
В пределах музея есть множество известных анимационных персонажей — например, робот из мультфильма «Небесный замок Лапута» или Тоторо, выглядывающий из окошка билетной кассы. В музее есть статуэтки котиков, лабиринты, винтовые лестницы, тайные ходы, фонари и необычайные зверушки.
На первом этаже посетители могут ознакомиться с историей развития анимэ-мультипликации. Здесь работает кинотеатр, где воспроизводятся короткометражки Гибли. Следующий этаж оформлен как анимационная студия. В некоторых комнатах содержатся скетчи, концепты героев, эскизы. Гости музея знакомятся с пошаговым созданием анимэ-мультфильма.
На третьем этаже работают кафе и магазинчик сувениров. Для детей младше 12 лет оформлен отдельный зал, где маленьких посетителей ожидает большой плюшевый котобус. Наверху есть сад, посетить который можно только в благоприятную погоду.